Важную роль в научной жизни института играют диссертационные советы, предназначенные для защиты диссертационных исследований на соискание ученой степени доктора, кандидата наук и присвоению соответствующей ученой степени.

В настоящее время для защиты диссертационных исследований в институте открыты и функционируют три совета:

• ДС 215.007.02
• ДС 215.007.02
• ДСО (объединненый)  999.006.03

Защита диссертационных исследований ведется по 6 специальностям и 3 отраслям наук.

Возглавляют диссертационные советы авторитетные в научном сообществе ученые, длительное время, занимающееся активной научно-педагогической деятельностью в Военном институте (инженерно-техническом):

• доктор технических наук, профессор Бирюков Александр Николаевич;
• доктор технических наук, профессор Игнатчик Виктор Сергеевич;
• доктор педагогических наук, профессор Печников Андрей Николаевич.

Защита диссертационных исследований в советах проходит ежегодно.